Technicien Formation Recherche en Biologie H/F - 69

Votre rôle et missions.
Le poste est basé dans l'Unité Mixte de Recherche Anses VetAgro Sup Mycoplasmoses Animales. Les missions de l'UMR MYCO sont la recherche et la formation par la recherche dans le domaine de la Mycoplasmologie chez les animaux, avec un savoir-faire historique pour les mycoplasmes des ruminants. À cela s'ajoutent des missions d'expertise et de référence propres à l'Anses ainsi que des missions d'enseignement propres à VetAgro Sup. Les travaux scientifiques de l'UMR portent sur l'étude de la biodiversité des bactéries du genre Mycoplasma et l'expression clinique des maladies associées. L'UMR pilote notamment le réseau VIGIMYC qui, outre ses missions d'épidémiosurveillance et d'aide au diagnostic auprès des laboratoires d'analyse vétérinaires, permet l'entretien d'une collection de souches sur laquelle s'appuient de nombreux projets de recherche en partenariat.
Vos missions incluront principalement :
Participation aux projets de recherche de l'UMR, en particulier en biologie moléculaire (site Anses)
Sous typage des souches par des techniques de biologie moléculaire ou de génomique (extraction d'ADN, contrôles qualité associés, PCR, MLST, PFGE...)
Caractérisation des souches par PCR (y compris contribution aux développements méthodologiques), séquençage (Sanger ou WGS) et participation aux analyses bio-informatiques
Réalisation de mesures de CMI (Concentrations Minimales Inhibitrices) et contribution au développement de méthodes alternatives pour la détermination de l'antibiosensibilité des souches

Participation au maintien de la dynamique actuelle du réseau Vigimyc (site Anses)
Prise en charge des cultures envoyées par les laboratoires partenaires (enregistrement dans un logiciel dédié et mise en analyse)
Mise en oeuvre de l'identification des souches de mycoplasmes issues de ces prélèvements (membrane-filtration dot immunoblotting, PCR spécifique d'espèce, PCR 16S et séquençage, etc.)
Gestion de la collection des souches associées

Participation aux activités de recherche en lien avec les projets « Mycoplasmes et troubles de la reproduction chez la chienne » « mycoplasmes de la sphère respiratoire des chiens » « diversité des mycoplasmes en polyélevages » (campus vétérinaire VAS)
En plus des activités de recherche sur ce projet (biologie moléculaire), sur le modèle de ce qui est fait pour Vigimyc, contribuer à la montée en puissance des activités diagnostiques pour les mycoplasmes hors ruminants, en lien avec les autres plateformes de VAS. Développer des outils diagnostiques.

Activités transversales (Anses ou VAS)
Compte-rendu individuel et participation à la traçabilité collective des essais conduits en laboratoire
Participation à la rédaction de protocoles, aux suivis métrologiques et à la gestion des consommables et milieux de culture (commandes et stockages secondaires)
Participation à la formation d'étudiants stagiaires (niveau Bac à doctorat)